Der Atari 1040ST ist mit dem 520ST weitgehend identlich, jedoch mit 1MB Speicher und mitgeliefertem Monitor ausgestattet. Auch ein Diskettenlaufwerk mit 720kB Kapazität ist seitlich eingebaut. Der Atari1040 war als preiswerte Alternative und Konkurrenz zum Amiga entwickelt worden. Mit seinem eingebauten MIDI Interface wurde er vor allem in Studios zum Mitschnitt von Synthesizer und Keyboard-Aufnahmen eingesetzt. Die damals entwickelten MIDI-Programme TwentyFour und dessen Nachfolger sind teilweise heute noch im Einsatz.

Der mitgelieferte Monitor war zwar nur monochrom, lieferte aber selbst für heutige Verhältnisse ein sehr gutes Bild, so daß das Gerät gerne zu Zwecken der Textverarbeitung und einfachem Desktop-Publishing verwendet wurde.